阴茎肿痛在小儿外科门诊经常会碰见，哪个科室具体如下：

1、急诊：如果当地医院分的科并不是很细，如县级医院或者县市级医院，分科并不是很细，首先要到急诊科，让急诊的外科医生做简单的评估以后再进行下一步处理；

2、泌尿外科：急诊做简单的评估以后可以分到泌尿外科，让当地的泌尿外科医生进行简单查体，看到底是外伤、感染，还是因为蚊虫叮咬这种因素，造成了孩子的阴茎肿痛；

3、小儿泌尿外专科：如果泌尿外科医生主要是成人方向，孩子是在省城或者是省会里面，或者在更大的城市，有小儿泌尿外科专科就更好，可以挂小儿泌尿外专科，让专科医生再评估是否是因为局部感染造成的阴茎肿痛。因为阴茎肿痛大部分是因为感染因素，因为包皮长、包茎，容易滋生细菌，加之孩子喝水少、排尿少，各种因素诱发的包皮龟头炎。在肿痛同时可能还合并有尿急、尿频、尿痛这种尿路感染情况，如果出现这种情况，一定要让孩子多喝水、多排尿，同时如果孩子肿痛比较明显，可以进一步查阴茎的彩超，看阴茎皮下或者海绵体的情况。

所以说如果孩子出现阴茎肿痛，要根据当地的医疗环境，一般首选外科，如果外科里面分得更细，最好可以挂小儿泌尿外科。