针灸治病的原理，实际上在现代科技条件下也是有待深入研究的一个课题。
中医理论认为，实际上针灸就是在经络学术的指导下针刺或者艾灸，以刺激穴位为主，起到调和阴阳，即疏通经络、行气活血，激发人体的正气。
通过扶正祛邪，激活人体自身的免疫力来恢复身体健康，它是这样的方式，包括其他的像艾灸或者其他的各个推拿、按摩、拔罐，其实都是在经络学的指导下。
当然要按现在来看，因为穴位失去了神经的支配，或者平常扎针灸，如果没有感觉便没有针灸疗效，所以现在看来主要是因为针刺，实际上就是神经系统来起主要的作用，所以功效就是促进人体自我修复、自我康复，恢复健康的作用机理和功效。
