儿童室间隔缺损会导致生长发育落后、出汗较多、频繁感冒。若室间隔缺损在5mm以上，则需手术治疗。少部分膜部室间隔缺损在3mm以上，2岁后需手术处理。

室间隔手术处理有开胸与内科介入之分，内科介入仅可治疗少部分室间隔缺损，适应症较少。但几乎所有室间隔缺损均可通过外科手术进行矫治。内科介入手术方式是在缺损中放置封堵器，优点为心脏不停跳、创伤较小、恢复较快；缺点为封堵需在X光引导下进行介入，且封堵器需永久放置于心脏中。所有室间隔缺损均可进行开胸手术，但缺点为创伤较大、恢复较慢。