扁桃体手术后出现低热，甚至某些患者3天内高热，属于正常现象，是扁桃体术后细菌释放入血引发的机体正常反应。扁桃体不处于完全无菌的环境，在扁桃体表面以及扁桃体隐窝内，会正常存留某些病毒、细菌、真菌及代谢产物。

机体抵抗力强时，病菌、细菌处于被压制的状态，进行扁桃体手术时这些致病微生物，可能会通过组织间隙吸收入血，在血液中经过中性粒细胞，激发身体内的内源性致热原，调节体温调节中枢，引起发热，属于机体正常免疫反应。如果体温不超过38.5℃，无需紧张。因此扁桃体手术后低热比较正常，通常不超过72小时。