十三价疫苗需要注射四针，通常是在出生后2个月、4个月以及6个月分别注射三针，儿童1岁半后再进行一次加强注射。注射十三价疫苗后，对儿童保护为5年左右。
十三价肺炎疫苗只是针对肺炎球菌的十三种荚膜型，有十三个不同小分支，各分支均可侵入体内造成感染，除可以引起肺炎外，还可以引起其他呼吸道感染。进行疫苗注射后，可对十三种荚膜型造成的感染进行预防，但并非注射十三价疫苗后就不会出现肺炎。因为儿童患肺炎，除肺炎球菌的感染外还存在较多原因，呼吸道合胞病毒与腺病毒、支原体、衣原体以及链球菌、葡萄球菌等均可导致肺炎。所以十三价肺炎疫苗仅可针对肺炎球菌引起感染，存在预防作用。
