如果临床上怀疑是脑膜炎，脑膜炎若渗出比较明显，脑脊液可增多，CT可观察到儿童脑室扩张、蛛网膜下腔扩大，CT也能够诊断患儿是否具有脑膜炎，对临床提供诊断，故CT可诊断小儿是否存在脑膜炎。此外，结合患者脑脊液检查，也能够给临床提供清晰诊断。
如果儿童怀疑脑膜炎，做核磁会更加明显，因为核磁共振对脑膜炎诊断比较敏感，能够看到信号在T2像上明显增高，而且脑脊液明显增多、脑室扩张、蛛网膜下腔也扩张明显，从而诊断脑膜炎更加准确。在怀疑患儿有脑膜炎时，要选择核磁共振检查，CT对骨质破坏，如肿瘤导致骨质破坏，要比核磁会更加敏感，故各个检查均有一定特点，而且是互为补充、相互印证关系。
