月经不调主要有两种原因引起，结构性改变引起月经不调和非结构性原因引起的月经不调，结构性改变包括子宫内膜息肉、子宫腺肌症、子宫肌瘤、子宫内膜癌或内膜癌癌前病变、宫腔粘连，以上情况一般不影响排卵。非结构性原因引起的月经不调，包括血液系统疾病引起的月经不调，比如再生障碍性贫血、白血病引起月经过多。但只要卵巢功能正常，也不影响排卵。
还有排卵障碍引起的月经不调，这一类疾病引起的月经不调会影响排卵，主要包括更年期女性卵巢功能下降、多囊卵巢综合征、高泌乳素血症、黄体功能不全引起的月经不调。还有非结构性原因引起，比如医源性原因，还有子宫内膜局部改变引起，但只要卵巢功能正常，没有其它内分泌疾病，也不影响排卵。
