出现膝盖、肩膀疼痛后，就诊的医院不同，选择的科室也不同，常见于以下几种情况：

1、社区医院：患者可以挂外科，或者中医骨伤科、疼痛科等；

2、二级医院：患者可以挂骨科，或者疼痛科等；

3、三甲医院：患者可以挂关节外科，或者运动医学科。如果膝盖、肩膀、腰部等部位都出现疼痛，并且伴有肿胀，患者则应该挂风湿科，进行必要的化验检查，观察是否有类风湿等情况。

因此，膝盖、肩膀疼痛的患者在不同的医院，选择的科室也不同。