无论是男性还是女性，若肾结石发作，一般是腰部的疼痛，即肾区的疼痛，且肾区的疼痛类似。肾区上限是胸11腰椎，下限是第3腰椎，内侧线是后正中线旁开2.5cm，外侧线是后正中线旁开7.5cm，所以肾结石大约是在此处。
除非肾脏位置发生改变，例如肾脏上升不良的病人出现肾结石，可能肾结石在肾区的位置未被发现，而在别的位置出现。
肾结石的疼痛不可能比较局限，因为肾结石的疼痛是内脏疼痛，比较弥漫，所以肾结石的疼痛，有时向输尿管、膀胱，或者腹股沟发射。
特别是肾结石靠近输尿管，卡在输尿管第一个狭窄部位出现的疼痛时，此类疼痛很可能向输尿管、向下腹部放射。向输尿管、向下腹部放射是肾结石或者输尿管结石的一个特征性表现。
若出现腰部疼痛时，需要进一步做影像学检查，特别是泌尿系统彩超的检查，更加明确肾结石的位置。若是肾结石导致的疼痛，需要进行积极处理。
