导致龟头炎的病原微生物，主要有以下几种：
1、细菌：如大肠杆菌、金黄色葡萄球菌或变形杆菌，此类感染属于比较普通的导致泌尿系感染细菌。患者常存在包皮过长或包茎，平时又不太注重个人外生殖器的卫生，长期包皮垢积累在包皮、龟头间，特别是沉积在冠状沟位置，便容易导致包皮、龟头发炎。在此时由于上述属于常见的细菌，比如大肠杆菌等细菌感染所导致的疾病，通常采用红霉素或百多邦等具有杀菌功能的外用软膏，均可能有比较好的疗效。在治疗期间，临床鼓励患者每天清洗龟头，必要时也可使用1∶3000的高锰酸钾液浸泡龟头，可能好得更快；
2、真菌：真菌造成包皮龟头炎的临床特点，是局部痒痛感较重，而且包皮、龟头上存在一层很难洗干净的白色污垢。进行病原体的鉴定时，常发现真菌的菌丝或孢子。确诊为真菌感染后，便不能再使用百多邦或红霉素等药物，建议使用克霉唑软膏等抗真菌软膏进行治疗。
