做试管不允许选择胎儿性别。但是有一种情况比较例外，可以选择胎儿性别。也就是指父母双方携带有性染色体遗传疾病，即性染色体上携带致病基因的父母双方，做试管婴儿时可以选择性别。
因为有的染色体异常，可能是在X染色体上，比如染色体来自于父亲，他的后代如果是女孩，一定会携带爸爸的X染色体，即一定会携带致病基因，而遗传爸爸的疾病，所以这种特殊的情况可以选择性别，可以选择不要女孩。除这种特殊情况之外，不能够进行胎儿性别的选择，因为胎儿性别选择可能会导致男女出生比例失调，对以后的整体人口比例产生非常重大、不良的社会影响。
