对大多数内科或内分泌医生而言，甲功三项主要是指FT3、FT4、TSH的水平。因为甲亢或甲减患者调整药物时，最基本的三项就是FT3、FT4、TSH的水平，能够了解、评定甲亢控制指标、甲减替代剂量是否合适。
但怀孕时妇产科进行筛查时，甲功三项主要指TSH、FT4、TPO的水平，主要倾向于怀孕期孕妇的甲功是否会对胎儿造成影响。
所以，不同的专业组可能对甲功三项的要求不同。内分泌科更侧重在甲亢、甲减患者功能替代、抑制情况。甲亢患者在检查的时候可能还会加上TRAb或TSAb，主要是更好地观察甲亢的控制指标和复发指标，甲减患者进行基本的三项检查即可。
孕妇主要倾向胎儿健康、母体健康或右甲状腺素的替代剂量是否合适，主要是检测FT4、TSH、TPO的水平，进行初步筛查以及药物剂量的调整，都倾向于这三项。
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