男性小腹痛常见的原因是慢性前列腺炎，需及时到泌尿外科就医，通过精液细菌、支原体、衣原体培养，通常能找到致病微生物。可以使用有效的抗生素，如磷霉素氨丁三醇散、左氧氟沙星片、盐酸多西环素、盐酸米诺环素等。
通过上述药物治疗，多数男性小腹痛的症状会明显好转。此外，在治疗期间需大量喝水、避免饮酒、避免同房等。男性发生慢性前列腺炎时，由于感染性致病菌会沿输精管走行区，引起输精管发炎，会出现小腹隐痛、胀痛症状。
由于感染性致病微生物在前列腺表面形成黏膜糜烂、水肿，还会导致后尿道和膀胱颈部发生炎症，会出现膀胱颈部黏膜糜烂，会出现小腹正中隐痛、胀痛症状。
