霉菌性鼻窦炎一般需要通过手术治疗，术后患者应注意按时复查，在鼻内窥镜下换药。术中可在鼻内窥镜下开放病变筛窦、上颌窦，通过扩大窦口将窦内阻留的霉菌团块清理干净。
手术要点是必须将窦内干酪样的真菌团块彻底清理干净，而上颌窦病变因为在术中无法通过扩大开放上颌窦自然口，充分关上上颌窦腔，并彻底清除病变，尤其是位于上颌窦前内下角的病变。在这种情况下，一般需要行上颌窦根治进路，或者鼻内镜下泪前隐窝进路清除病变。鼻内镜下泪前隐窝进路手术因为创伤小，恢复快，近年来较多采用。
霉菌性鼻窦炎又称真菌性鼻窦炎，临床表现因不同的临床类型和严重程度而异，患者经常出现的症状是单侧鼻塞、流脓涕，会有恶臭的临床表现，一般都没有全身的症状。鼻窦CT检查是术前重要诊断参考，但最终诊断是依据病理。一般鼻窦CT都显示单窦，不均匀密度增高，70%可见高密度钙化斑，或者可有窦壁的膨胀和吸收，没有骨质破坏。