利福平和利福喷丁属于同一类抗结核药物，两种药物效果基本相同。利福喷丁是长效制剂，每周使用两次，胃肠道反应发生比较少，发生肝功能损伤的几率比利福平少。

一般抗结核治疗首选利福平，如果利福平出现肝损伤或者严重胃肠道反应可以选用利福喷丁替代，但是结核性脑膜炎病人不能使用利福喷丁，因为利福喷丁不能透过血脑屏障，不能在脑脊液里发挥抗菌作用。