氨咖黄敏胶囊的副作用并不大，氨咖黄敏胶囊属于非处方药，一般非处方药的毒副作用都比较小，患者能凭借自身经验来使用。但是在使用过程中也应该注意，氨咖黄敏胶囊也有可能导致患者出现某些副作用，如胃肠道的症状，表现为食欲减退、恶心、呕吐等症状，一般较轻。
氨咖黄敏胶囊可能导致患者出现困倦、乏力、嗜睡，以及精神减退等相关症状，因为药物中所含有的马来酸氯苯敏，具有一定的镇静效果。因此，在使用药物期间，不能驾驶车辆、从事高空作业、操作机械等需要集中注意力的工作。除此之外，在使用药物时应该注意，不能饮酒，酒精可能会加重中枢神经系统的抑制作用，并且还有可能会加重胃肠道症状。另外，还需要注意的是不能长时间使用氨咖黄敏胶囊，如果使用3-7天，症状仍然没有明显缓解，一定及时到医院就诊。
