任何手术都有风险，任何药物都有副作用，只是副作用大小不同。该手术风险其实和开创手术风险相同，但风险相对小。麻醉风险，开放手术风险是全麻手术，而该手术在基础麻醉下局麻手术为主，基础麻醉是全身给予镇定药，局麻下完成手术。所以麻醉风险很小。
该手术和开放手术相同，都有神经损伤风险，但损伤风险也很小。开放手术在开放切口内对神经操作，而该手术在7.5mm细管中，在放大镜下可见神经根很粗，伤到神经风险很小。该手术采取局麻手术，因为碰到神经患者会痛，患者有痛感反馈，医生会停止手术，神经损伤风险很小。最后感染风险，开放手术是成熟手术，其实神经风险很低。但开放手术是大切口，进行内植物，开放中接触感染风险增加。椎间孔手术在7.5mm细管中，手术全程有水流灌注，感染风险也小。该手术与大手术风险相同，但发生几率很小。
