免疫系统疾病又称为自身免疫性疾病，主要包括两类，一类是器官特异性的自身免疫病，一类是器官非特性的自身免疫病。
在临床上把器官特异性自身免疫病常常称为风湿病，例如系统性红斑狼疮、类风湿关节炎、干燥综合征、皮肌炎、硬皮病、强直性脊柱炎等，器官非特异性的自身免疫病包括自身免疫性溶血性贫血、免疫性血小板减少、自身免疫性的肝病、甲状腺炎、甲状腺功能低下、桥本氏病等。
自身免疫性疾病有相当多的种类，主要是由免疫调节功能的障碍、免疫调节的异常所引起。除此之外还有免疫缺陷性疾病、免疫增值性疾病等，所以免疫系统疾病是多种疾病。
当出现免疫系统异常时一定到医院请专科大夫进行诊治，进行相关的检查才能明确诊断，只有明确诊断才能进行规范治疗。
