阴蒂上如果长小疙瘩并且瘙痒，有可能是局部炎症、尖锐湿疣等原因导致，具体如下：

1、局部炎症：由于阴蒂局部的神经比较丰富，血管也特别丰富、特别敏感，所以有可能出现炎症性反应而导致局部出现小的红肿，并且伴有瘙痒。建议可以考虑局部涂抗生素治疗，比如常用的就是红霉素软膏或者是红霉素眼膏，涂到局部都可以，但是注意涂药的时候最好避开尿道口，避免引起对尿道的刺激；

2、尖锐湿疣：因为HPV感染，比如HPV6型、HPV11型感染之后，通常会导致外阴局部出现灰白色、菜花一样的赘生物，可以长在阴蒂上，也可以长到小阴唇上，还可以长到肛门周围。建议可以考虑用二氧化碳激光治疗，在治疗的时候一定注意避免对阴蒂造成损伤。

上述就是阴蒂上长小疙瘩临床常见的病因，建议日常生活中加强外阴局部的护理，减少炎症产生。