患者怀疑有肠结核，需做肠镜、腹部CT、胸部CT，血沉即红细胞沉降率、结核菌素试验和T-SPOT检查，帮助明确是否有肠结核或者肠外结核。
进行肠镜检查时在回盲部发现肿物或者重型溃疡，是肠结核的典型表现，更怀疑局部肠道病变，很可能发生肠结核。确诊需病理诊断，通过取组织活检，抗酸染色，观察是否有肠结核的可能。另外还需进行腹部CT检查，观察是否合并结核型腹膜炎，常规需做胸部CT，观察肺内有无肺结核。然后抽血查红细胞沉降率，患有肠结核红细胞沉降率会增快，T-SPOT值呈阳性，一些肠结核是全身系统性结核的局部表现，即患者原来可能患有肺结核。
因此患者怀疑有肠结核时，诊断肠结核，需抽血、做肠镜，以及胸腹部CT对患者进行综合诊断。
