性激素六项的检查时间一般选择月经的第3-5天，但具体时间取决于检查目的，具体如下：
1、观察女性基础卵巢功能，判断月经异常原因以及生育力时，通常在月经的第3-5天进行检查。但此时选择性激素五项检查即可，主要包括雌激素、雄激素、卵泡刺激素、黄体生成素以及泌乳素，对孕激素并不做检测。月经的第3-5天，处于女性的卵泡期，还未发生排卵，此时孕激素水平比较低，因此可检查普通的性激素五项；
2、观察排卵情况和黄体功能时，通常建议在月经前1周，进行性激素六项检查。月经前1周处于排卵后黄体期最为旺盛的阶段，在性激素五项基础上检测孕激素水平，可明确黄体功能、排卵情况。
因此，性激素的检查时间主要由检查目的而定，部分女性甚至需在整个月经周期内检查2次或以上，具体根据个人不同情况而有所差异。
