月经周期失眠，是由于激素水平变化引起睡眠中枢调节异常，导致的一种现象。月经来潮期间，由于雌激素从比较高浓度的状态，快速向比较低浓度水平下降，而使得内分泌环境变化，导致大脑调节中枢改变。人类睡眠是主动过程，主要受睡眠中枢调节，有睡眠意识或者睡眠状态。由于神经变化和睡眠周期改变，使睡眠中枢有向上传导到大脑皮层的上行抑制系统，上行抑制系统活跃使感觉和运动处在抑制的状态，则进入到睡眠。
人的神经系统存在上行抑制系统和上行激动系统，会调节睡眠和觉醒，使清醒以及睡眠相互转化。当大脑皮层活动，实际上是由脑深部的神经元控制，神经元类似于调节中枢和开关，控制大脑皮层的兴奋和感知睡眠，兴奋和感知睡眠与内分泌环境有重要关系，因为雌激素参与人体自主神经活动。由于月经期间雌激素水平快速变化，会使在月经周期中，上行抑制系统受到抑制，而上行激动系统被异常活跃，月经周期严重失眠会影响健康。在这时候，要学会调节生活节奏、调节心态 ，必要的时候可以用类似于安定类的催眠、助眠药物，改善睡眠。
