常有人询问，进行穿刺活检时，是否多数判断病灶为恶性。实际上，此答案并不绝对。进行穿刺活检的主要目的是获取病理组织，因为病理诊断是诊断的金标准。此处所提及的诊断，涵盖炎症性疾病、自身免疫性疾病、恶性和良性疾病等，仅是诊断过程的一部分。
例如对于皮肤的异常红斑进行穿刺活检，主要为了判断其属于何种皮肤病类型。若对某器官出现的异常肿物进行穿刺活检，其结果可能是良性或恶性变化。要确定穿刺活检的病理组织是否为恶性，先需观察其镜下特征及免疫组化的标志物检测。
如果在镜下观察到组织的分化程度很差，与邻近的正常组织存在显著的异型性，并有明显的病理性核分裂象。基于上述，可以确定为肿瘤，进一步判断为恶性肿瘤。对于已诊断为恶性肿瘤的病例，还需结合其临床分期，决定后续的治疗方案。
