脑血栓形成最重要的危险因素是动脉粥样硬化，动脉粥样硬化是一个长期慢性的发展过程。体内巨噬细胞吞噬脂质形成泡沫细胞，然后在内皮下面堆积，逐渐导致动脉粥样硬化斑块形成。

当动脉状硬化斑块表面的纤维帽较薄，脂质核较大，或者是表面有溃疡等不稳定的斑块情况下，在这个地方容易形成血栓，导致血小板聚集，还有纤维蛋白原把血小板粘连在一起，形成小栓子，把血管堵住，形成血栓。在动脉粥样硬化的防治方面，常见使用他汀类药物，可以降低血脂，对不稳定斑块进行稳定，使斑块纤维帽会较厚，脂质核较小，防止脑血栓形成。