临床上免疫比较重要，因为什么原因都找不出来的时候，可能会认为是免疫有问题。免疫有很多种检查，大部分是查血，血中的抗精子抗体、抗子宫内膜抗体。如果存在子宫内膜异位症，可以查看子宫内膜抗体，如果不做试管的病人，想自己怀孕，可以查抗精子抗体。如果是已经做了试管的病人，这两类其实意义不是太大。可以查血，查β2-GP1糖蛋白，还可以查狼疮复合物，还可以查核心抗体、抗心磷脂抗体很多抗体，包括CD系列和NK系列，基本上以抽血为主。
有的免疫医生认为，在月经期间也可以查，有的免疫医生认为，没有月经才可以查，有的免疫医生认为，要停药2周才可以查。但现在认为任意时间都可以查，因为就像CA125，在经期会凸显其问题，会变得特别高，但非经期可能就正常。如果是正常人，则不管是经期，还是非经期，CA125都正常。如果有子宫内膜异位症，或有一点子宫内膜异位症倾向，则在经期就会凸显CA125增高，所以在经期查免疫也可行。只是不同的免疫的专家，有不同的检测方法，这些方法都可以运用。另外还有地方查封闭抗体，但现在查的比较少。因为治疗也不是一定有非常明显的效果，并且风险很大。
