锥虫病的症状根据分期不同而不同，具体如下：
1、皮肤反应：人体的皮肤被舌蝇叮咬后，如果叮咬的局部有锥虫就会有皮肤反应。急性反应期皮肤可能会有小红点、肿包，但是皮肤的病变一般是自限性；
2、发烧、淋巴结肿大、脏器功能受损：锥虫在人体不断繁殖、生长，人体就会表现为发烧、淋巴结肿大和脏器功能受损。淋巴结的肿大，尤其是在皮肤浅表的部位很容易摸到，比如颈后、腋窝。发热为间断发热，就是发热几天热退，但是过一段时间虫体的抗原变异又会发烧；
3、大脑功能障碍：出现昏迷、昏睡，所以也叫非洲睡眠病。
锥虫病也分不同的类型，有的进展比较慢，可以有几年的病程，而进展很快的病程几个月，不及时治疗病人会出现生命危险。
