肠系膜淋巴结炎绝大多数情况下可以进行保守治疗。在治疗的时候一般应用广谱抗生素，因为是腹部感染，必要时会合并用抗厌氧菌的抗菌素，比如甲硝唑、替硝唑。病人一旦发生肠系膜淋巴结炎，表现为腹疼，一般需要5-7天的消炎药。同时在治疗过程中，要监测病人腹疼、腹部体征的改善情况，以及白细胞是否能逐渐降低到正常水平，这些都是反映炎症是否逐渐缓解的指标。
对于肠细胞淋巴结发炎，从诊断上有一部分患者容易和阑尾炎相混淆。特别是回肠末端的淋巴结炎，也表现为右下腹疼，阑尾炎也表现为右下腹疼，但是两者在治疗方法上有差别。严重的阑尾炎以手术治疗为主，而肠系膜淋巴结炎，绝大多数可以通过保守治疗得到缓解，必要时可以做腹部的影像学检查，对两者进行鉴别诊断，比如超声或者CT。
