冷冻囊胚移植的最佳时间实质上是排卵后的第5-6天，囊胚发育到这个阶段是最佳的移植时间。无论移植的是卵裂球第3天的胚胎还是囊胚，都要遵循孕激素转化的规律。
人体内存在一个种植窗的规律，应通过这个规律做移植。种植窗大概在排卵后的6-8天，此时种植窗是开放的，这个时候放置胚胎，等种植窗开放之后就可以容纳胚胎。如果错误的时间放置胚胎，可能种植窗是关闭的，放了胚胎也不能够怀孕。所以，最佳时间一定是按照排卵后和胚胎发育时间相符的规律。
简单的说，也就是排卵后的第5-6天放囊胚，排卵后的第3天放第3天的卵裂球胚胎。如果是冷冻的胚胎，采用人工周期的方法移植，通常是在孕激素做内膜转化的第3天，放的是第3天的冷冻胚胎，如果在内膜转化的第5-6天，放的是第5-6天的囊胚。所以一定是与胚胎发育阶段相符合，这就是最佳时间。
