先天性肠旋转不良是因为小肠、结肠围绕肠系膜上动脉，在旋转的过程中旋转异常或者旋转不到位，而造成的肠管扭转、肠系膜扭转，而引起的相关症状。

很多孩子在做完手术以后，可能后遗症就是相关的手术并发症，比如像伤口感染、脂肪液化、愈合不良、伤口后期腹壁疝。但是随着腔镜技术发展，后来采用微创的方式进行手术治疗，一般腹壁后遗症、并发症相对大大减少。

可能很多孩子做完手术以后，最大的问题就是再次粘连、再次梗阻。因为孩子比如不是在新生儿期做手术，而是在15-16岁或者12-13岁，因为从小长期肠道不是很通畅、不完全性肠梗阻，造成的周围粘连非常严重。甚至有些会引起肠管局部扩张或者局部狭窄很明显，造成局部炎症很严重。

就可能造成局部肠管不能利用，可能需要做肠切除肠吻合术，做完手术以后，可能有的孩子可能会有短肠综合征 、肠道吸收障碍、肠营养不良。甚至有的孩子在手术期间、术后可能会出现肠瘘、腹腔感染，此种严重的并发症或者后遗症。

因此先天性肠旋转手术后遗症很多，也很复杂，但是一般做完手术以后，相对还是恢复得可以的。除非是长期的、慢性的、旋转很重的孩子，做完手术以后可能需要肠切除、肠吻合，可能出现的后遗症更多，一般孩子恢复得都还是可以的，非常良好的。