检查HPV病毒感染的方法，根据其类型不同而有所不同，常见情况如下：

1、低危型：通常不会在无任何症状时检查，在病变时才会检查，即在病灶处取部分样本。如外阴、阴道或男性生殖道外存在新生物，此时怀疑为HPV低危型感染导致，可能在病变表面用细而柔软的刷子，刷取组织进行化验，化验结果可表明是否有病毒感染存在；

2、高危型：是常规筛查，可在宫颈部位取材。检查病毒感染会使用一把较细且柔软的刷子，在宫颈表面刷取部分脱落细胞，脱落细胞粘到刷子上，并将刷子放在细胞保存液中，然后在显微镜下经过相应的化验，寻找是否有病毒颗粒存在。