大部分急性胃肠炎出现发烧，通常2-3天即可恢复正常。部分严重的肠胃炎，例如急性出血性胃肠炎、急性坏死性肠炎等，甚至需要通过外科介入切掉一段肠管进行治疗，这时恢复时间可能较长。
通常胃肠炎伴有发烧时，一般会合并细菌感染，此时应到医院进行基本的检查，如大便常规、血常规等，大便常规可以观察有无白细胞，血常规可以了解白细胞是否增高，尤其中性粒细胞是否增高，若出现上述情况，可能为细菌感染，通常需要使用抗生素治疗。这时应补充患者血容量，尽量多饮水，可饮用淡盐水，避免发生水电解质紊乱，尤其是血钾低的情况，此时也可饮用果汁类饮品如橙汁等，含钾量较高，可补充电解质。
