部分患儿做完腭裂手术后可能还需要进行二期整复，包括初次腭裂手术之后仍然存在影响语音结构功能异常，但腭裂术后软腭本身功能不全或影响语音清晰度的腭瘘治疗，腭裂手术目的是关闭裂隙恢复正常的腭咽闭合功能，为正常的语音创造条件。但并不是所有的腭裂患儿通过一次手术就能够完全恢复，由于多方面的影响，由于畸形类型、畸形程度、软腭发育、医生技术、术后护理等，还有手术年龄都可能造成一次手术达不到腭咽闭合功能的目的。如果出现并发症影响腭咽闭合功能，并通过机能训练又无法改善，需要考虑二次腭裂手术。腭裂二期整复的时机一般在初期腭裂手术1年以后，即第一次腭裂手术1年以后，但对于比较严重的复裂需要尽快再次手术，至少要上次手术后4-6个月以后才能再做。

腭裂二期整复的内容主要包括重建具有理想功能腭帆提肌的吊环，消除影响语音和口腔封闭的腭瘘，对于咽腔深大、软腭短小的患者，应进行软腭后推，对于严重的腭裂以及肌肉瘢痕进行松解。腭裂整复术另外一个目的是减少之后的咽成形术，因为早做，闭合功能恢复，不需要之后做咽成形术。因为咽成形术毕竟是非生理性结构，做腭成形术是生理性结构，所以尽量做二期整复以后就避免再次咽成形术，让患儿腭咽闭合功能形式是在生理性的正常结构下进行，这就是做二期的目的。