男性小便发黄有异味出现的原因较多，具体分析如下：

1、慢性前列腺炎：最常见于慢性前列腺炎，病人发生慢性前列腺炎时，由于感染性致病菌刺激前列腺部尿道黏膜，导致黏膜水肿、糜烂，还会引起前列腺腺管发炎，引起腺体炎性肿大。前列腺腺体炎性肿大后，会引起膀胱颈部水肿，同时导致膀胱颈部黏膜水肿、糜烂，病人会出现尿频、排尿不尽和残余尿现象。残余尿中致病菌刺激尿素分解，产生氨气，就会导致尿液出现有异味症状。同时由于残余尿在膀胱内浓缩，会出现小便发黄、尿液浑浊现象，病人出现上述症状时，应及时到泌尿外科就医；

2、尿道炎：男性小便发黄有异味，还见于尿道炎。病人发生淋菌性尿道炎时，也会导致尿液浓缩，出现小便发黄现象。同时由于淋菌导致脓性分泌物，产生脓性恶臭气味，也会导致尿液有臭味现象。

病人出现上述症状时，应及时到泌尿外科或皮肤性病科就医，通过规范的治疗后，多数病人上述症状会明显好转。