孩子口服益生菌的好处和坏处分别如下：

1、好处：吃益生菌可以调节肠道菌群，改善肠道功能，缓解消化道不适的症状，如恶心、呕吐、腹泻、便秘、肠绞痛、肠胀气等，胃肠道功能紊乱的表现。

另外孩子吃益生菌可以抑制有害菌定植，改善机体免疫状态，过敏的孩子可以缓解过敏，抵抗力差的孩子可以增加抵抗力，益生菌定植改善肠道菌群，也利于某些营养物质的吸收；

2、坏处：长期应用益生菌或者滥用益生菌，可能会影响正常菌群系统的建立，长期应用益生菌，有一部分益生菌，如屎肠球菌等可能会携带某些容易诱导药物致敏的基因，反而会导致身体会对某些药物产生耐药性，要在医生指导下应用益生菌，不能滥用。益生菌虽然有好处，但也要根据具体情况合理应用，只有当孩子有肠道菌群失调的情况，才可以选择适合孩子的益生菌应用。肠道益生菌多是来自于健康人体，以及长期食品应用过程中提取有益于孩子健康的菌株，但不建议长期应用益生菌，一般可以用1-2周，不能超过3周。