微波治疗对宫颈的危害，通常有以下几种：
1、使宫颈变硬、弹性变差，可能会导致以后怀孕生产时，宫颈扩张较慢，造成顺产比较困难，或怀孕后早产概率增加等；
2、宫颈接受微波治疗后，宫颈上皮通常被破坏，导致柱状上皮回退至宫颈管内，可能会增加宫颈筛查的困难性，即做宫颈筛查时，较难发现宫颈管内是否有病变。
以前微波治疗多用于宫颈糜烂的治疗，但现在认为宫颈糜烂不是病，而是一种生理现象，排除相应疾病后的宫颈糜烂，一般不需要特殊治疗。但有部分癌前病变比较表浅，范围较窄，可以采用微波的方式进行治疗，但应严格把握微波治疗的治疗指征。
