进行输尿管软镜碎石手术，首先要清洗会阴部，消毒会阴部，然后通过输尿管镜放入导丝，放到有结石的输尿管里。观察结石部位，观察输尿管的扩张程度，之后把导丝放入输尿管软镜里。
超滑导丝固定以后要拔出输尿管镜，观察镜取出以后，放入输尿管软镜的鞘，顺着导丝放入鞘，缓慢旋转进入，一直到肾盂、输尿管交叉口，然后开始把输尿管软镜顺着镜鞘放入。
此时要一边注水，一边放镜，观察结石，如肾盂结石、输尿管结石、肾盏结石，进行碎石、冲洗。把结石粉末化、粉碎以后，大的结石可以通过网篮取出，小的结石可以自行排出。
在碎石结束以后，拔出输尿管软镜，拔出镜鞘，然后顺着导丝放入F4.7的双J管，引流肾脏尿液，近端在输尿管、肾盂交界处，远端在膀胱处，最后拔出导丝，手术完成。
