注射九价疫苗注意事项较多，部分地方疫苗数量较少，需要预约到后才可以进行注射，部分地方为预约1针则注射1针，而下1针无法知道具体注射时间，因为可能出现没有针剂的情况，部分地方预约到名额后可以保留3针。九价疫苗年龄范围较窄，即16-26岁，如果年龄<16岁或>26岁等人群均应避免注射。
可能部分人对疫苗相关成分过敏，有时也会存在疫苗相关副反应，其症状较轻，多在局部注射部位出现疼痛、硬结等症状，部分人可能还会出现发热，通常体温为38℃以下，大部分症状可以在24-48小时缓解。
如果本身存在发热、感冒、疾病处在急性期没有恢复等情况需要避免进行注射，月经期可以注射疫苗，无论为月经期间、月经刚干净，还是月经即将来潮等情况均可以注射疫苗。但部分人月经来潮时出现严重不适，如痛经严重或者头痛不适等，此种情况下需要避免在月经期注射疫苗。
通常疫苗效果较佳，需要6个月内将3针注射完毕。如果出现特殊情况需要变更时间时，无法提前进行注射，可以退后部分时间，最迟可以在1年之内打完，但6个月按时间注射完毕效果较佳。
