免疫组化分析存在误差，首先技术上有完整的质量控制，在免疫组化的操作当中，必须有适当阳性与阴性对照。如对照组被忽略或者是不理想时，免疫组化染色的结果就要谨慎判读。每一种免疫组化的抗体试剂都有各自的特异性和敏感性，没有一种免疫组化的抗体是完美、理想的。

往往在病理诊断中会选用一组抗体，比使用单一的抗体更准确。免疫组化的正确结果，不仅要依靠技术、步骤上规范化的操作，更要有正确合理的判读。在报告免疫组化染色结果时，不应该孤立的解释，而应该考虑到诊断与鉴别诊断的疾病，所应用的抗体的特性、病变组织的性质，同时还要注意假阳性与假阴性的干扰。

所以，病理医生和病理科的技术人员，不仅要充分认识到免疫组化的缺陷，而且要努力避免由于缺陷和不足给诊断带来的误区。病理医生和技术人员也在工作中不断的学习和研究，努力实现免疫组化、规范化、标准化，才能真正发挥免疫组化在病理诊断中和临床治疗中的指导作用。