神经元特异性烯醇化酶的特异性并不高，较多情况下可能会有升高。首先研究发现脑梗塞患者血液中可以有神经元特异性烯醇化酶升高，但是酶的升高对于判断脑梗发生时间或严重程度，并不像心肌酶那样具有较大的特异性。其次研究也发现对于儿童有癫痫的情况，在癫痫发作之后也会有神经元特异性烯醇化酶升高，所以，此酶虽然称为神经元特异性烯醇化酶，但特异性并不高。
此外，神经元特异性烯醇化酶还可以在肺部有内分泌肿瘤的情况下升高。所以，对于神经元特异性烯醇化酶升高的解读，可能是需要结合更多检查，请专业医生判断，结合具体情况以及疾病而分析。
