桥本氏甲状腺炎发生了甲状腺功能减退症，称为桥本氏甲减。这时患者主要出现记忆力减退、嗜睡、关节疼痛、体重增加、黏液性水肿。此水肿是一种非常特殊的水肿，皮肤表面光亮，压之无洼陷感，累及到心脏时发生心音低钝、心率慢、心包积液。女性患者出现月经紊乱，以月经量增多为其表现，并可出现不孕不育症。

发生甲状腺功能减退症时，患者还可以出现甲减性肝损害，主要表现为转氨酶的轻度增高。发生此情况时，应该给予左甲状腺激素替代治疗。一般从小剂量开始，逐渐加至完全能够替代的剂量。

桥本氏甲状腺炎导致的甲状腺功能减退症，患者需要终身服用左甲状腺激素替代治疗。因为在此情况下，淋巴细胞逐渐代替了甲状腺组织，使得机体甲状腺激素合成、分泌的场所逐渐减少。而机体没有地方合成甲状腺激素，所以只能靠外源性的甲状腺激素而完成。

而桥本氏甲状腺炎也是机体发生自身免疫所导致的一组自身免疫性甲状腺疾病。