大部分急性播散性脑脊髓膜炎不会复发，临床中也可以看到复发性病例，通常第一次病情稳定数月以后再次发作或者再次病变。急性播散性脑脊髓膜炎可以出现多发性损害，这种损害可以短期内出现在不同位置，比如脑、脊髓等结构，此时不成为复发。临床中复发通常与抗体阳性有关，比如MOG(髓鞘少突胶质细胞糖蛋白抗体)抗体阳性，此时属于复发的一种。
急性播散性脑脊髓膜炎，在儿童期或者年轻的患者中，复发概率比较高。患有急性播散性脑脊髓炎后，要定期进行磁共振的复查，或观察症状是否出现，比如眼睛视物模糊、肢体偏瘫，以及大小便困难等表现，进行综合分析。当发现复发时需要给予免疫治疗，包括吗替麦考酚酯、他克莫司等，必要时需进行第二次急性期治疗，比如给予丙种球蛋白、大剂量激素冲击治疗等，可以得到比较好的缓解。
