先天性房间隔缺损的治疗方案应根据病人的具体情况进行具体制定，在临床上先天性房间隔缺损大致分为两型：
1、一孔型：其又称原发孔型，此类房间隔缺损通常应该进行开胸手术治疗；
2、二孔型：其又称中央型房间隔缺损，如果边缘条件允许，可以通过血管进入或者开胸进入，进行根治，进行封堵治疗，对于比较大的二孔型房间隔缺损，边缘不太好，还是考虑进行开胸手术治疗。
因此最终先天性房间隔缺损的治疗方案还是需要手术治疗，以达到完全纠正其病理解剖及相应病理、生理的目的。先天性心脏病房间隔缺损一般没有药物治疗，此时大缺损可能可以给予少量的强心利尿药，帮助维护心功能，其最终还是要靠手术治疗解决问题。
手术治疗又分传统的开胸治疗和相应的微创介入治疗，相应治疗方案的选择需要根据病人的具体情况，具体制定相应的治疗方案，适合病人自身条件才能够达到治疗效果。
