慢性牙根尖周炎不会自愈，根尖周炎一般进展方向是有牙体疾病，导致牙髓出现病变，牙髓病变严重到一定程度之后牙髓会慢慢坏死，坏死的牙髓会有大量细菌在繁殖，细菌会从根尖孔出来，导致根尖出现严重炎症。
牙髓完全坏死才会出现严重的根尖周病变，牙髓一旦坏死，牙髓腔就是死腔，里面没有活体组织，服用的抗生素药物，或者人体产生的抗体都是由血管运送到全身各处。由于牙髓已经完全坏死，其不可能有药物存在，也不可能有抗体存在。
所以，停用抗生素之后，细菌会源源不断地从牙髓腔中出来，导致根尖周病变一直不愈合，这就是慢性根尖周病变不会自愈的根本原因。牙髓内病灶不去除，根尖周病变不能愈合。
