临床上常见的支原体，如感染肺炎支原体后可以引起发热、咳嗽、咳痰等表现。而肺部体征，做影像学检查能看到肺部炎症表现，此为临床上肺炎支原体主要的表现。

如果是生殖系统感染支原体，如解脲支原体感染，在男性可引起尿频、尿急、尿痛等泌尿系急性感染的临床表现。女性感染可引起阴道炎症，还有宫颈炎，宫颈炎可出现局部溃疡、糜烂、水肿等表现，而生殖器感染经过性行为可以互相传染。