导致12岁女孩子宫内膜增厚，主要有以下几种原因：

1、下丘脑-垂体-卵巢轴激素间反馈条件不成熟：12岁处于青春期，青春期时下丘脑-垂体-卵巢轴激素间反馈条件不成熟，大脑中枢对雌激素正反馈存在缺陷，下丘脑、垂体与卵巢间，尚未建立稳定的与周期性调节。出现促卵泡激素呈持续性低水平，促黄体生成素亦不能形成排卵前锋，卵巢不能排卵，所以子宫内膜长期处于雌激素刺激，使子宫内膜一直处于增殖期，没有孕激素拮抗，所以子宫内膜出现增厚；

2、内分泌紊乱：发生误排卵性失调性子宫出血，月经出现不规则，导致淋漓不断出血。再加上年龄小，不能及时更换卫生巾，也不能保持外阴部卫生，所以容易继发感染，发生子宫内膜炎，导致子宫内膜增厚；

3、进食过多含有雌激素食物：导致体内雌激素水平升高或引起肥胖，或者服用含有雌激素某些药物、保健品。药物刺激引起子宫内膜过度增长，所以引起疾病，导致子宫内膜过度增厚。