治疗矮小症花费是否很大主要看孩子的年龄、矮小症的原因。矮小症在治疗过程中主要有两方面的花费，一方面主要是治疗过程中的监测所需要做的检查，这个花费其实每个孩子都差不多，因为抽血、必要时的核磁检查，任何年龄的孩子检查费用都差不多。除此之外，就是真正需要治疗或用药的费用。具体情况如下：

1、矮小症的原因不同：引起矮小症的原因有很多种，不同病因可能治疗花费也不同，比较常见的是生长激素缺乏所引起的矮小症。生长激素治疗主要是按照体重给药，所以如果孩子在小月龄时候开始治疗，比如3-4岁或4-5岁开始治疗，这时候体重比较小，所用的药物剂量相对比较少，花费可能相对会小。但如果8-9岁、9-10岁可能才开始治疗，这时候需要用的药物剂量较大，花费相对会较大；

2、药物剂型不同：生长激素有短效剂型、长效剂型，长效剂型使用更方便，但费用比短效贵2-3倍。

所以，对于矮小症的治疗，主要根据不同的孩子、不同的病因、不同的年龄，才能判断需要用花多少钱来治疗。