乙肝五项小三阳转阴是指表面抗原转阴，或者表面抗原转阴以后表面抗体阳转。这种情况下，HBV-DNA是降到最低检测值以下，而且肝功能持续正常，即便停用抗病毒药物，肝功能仍处于正常状态，就叫临床治愈，而不能称为痊愈。
患者体内乙肝病毒检测不到，DNA病毒的水平非常低，但在肝细胞内的肝细胞核中仍然存在着微量的cccDNA，这种DNA和肝细胞的基因整合到一起。如果机体的免疫力下降，这种微量的cccDNA就会被激活，激活以后就会出现乙肝病毒复制，就会造成肝脏损伤。
所以对于小三阳转阴以后临床治愈的患者，不能完全叫痊愈，只能称作临床治愈。患者仍然存在病毒复制的可能，会存在病情反复的情况，甚至有很少量的患者会发生癌变。
机体免疫力下降会导致乙肝病毒复燃，就是cccDNA激活、病毒复制。比如应用免疫抑制剂、大量饮酒、长期过度地劳累，都会降低机体的免疫力，导致乙肝病毒复燃。
