指甲变黄有多种原因，常见的是指甲有皮肤癣菌等真菌感染引起的灰指甲，医学上称为甲癣或者甲真菌病，真菌感染甲板后，可以导致指甲颜色改变，多数变黄，同时还会有指甲增厚、凸凹不平、失去光泽、破损等，这都是由于皮肤癣菌破坏甲板结构所引起，可以通过真菌检查来加以明确。但指甲变黄还有其他可能，比如局部因素，接触染料性物质，包括外涂碘伏，或者高锰酸钾溶液浸泡都可以使指甲变黄，抽烟、烟熏指甲也可以变黄。
另外全身因素可以影响到指甲变化，比如患有肝胆疾病、胆汁淤积、体内胆红素可以使全身皮肤黄染，也可以累及到指甲。再就是吃了过多柑橘、南瓜、胡萝卜等导致胡萝卜素血症，全身皮肤黄染、指甲变黄，还有少见疾病，比如黄甲综合征，患者可能同时还会合并有其他症状，比如水肿、呼吸系统慢性疾病等。
