临床上鼻窦炎经过积极规范治疗后，很少产生并发症。但部分患者鼻窦炎病情较为严重，若未及时治疗，炎症通常扩散较快，从而波及眼眶及颅内，导致患者出现眼球突出、肿胀、固定及视力下降等，甚至部分患者可出现高热、剧烈头痛等症状。若慢性鼻窦炎未得到及时控制和治疗，可使鼻黏膜功能减退，从而出现顽固性鼻塞、嗅觉减退、嗅觉丧失，甚至引起鼻息肉等并发症。
此外，若患者鼻窦炎由过敏性因素导致，鼻部周围器官通常也可出现过敏症状，包括眼睛、耳朵、咽喉等。较少见的严重鼻窦炎，如急性侵袭性真菌性鼻窦炎进展迅速，严重时可对患者生命带来危害，故需积极治疗。
