脑透明隔囊肿也叫做脑透明隔间腔，是透明隔部位形成的一个囊性包裹性的积液，即透明隔两层膜包裹脑脊液形成。这类囊肿通常是一种先天性结构，偶尔可以介于一些脑部炎症的因素，形成局部粘连所造成。但是无论哪一种脑透明隔囊肿，包裹性的脑脊液都很难自行消失。但透明隔囊肿通常并不会引起患者出现明显的症状，尤其是先天性脑透明隔囊肿，常是在患者进行头颅CT、头颅磁共振等检查时意外发现，并不会引起或者出现明显的症状。

虽然这类脑透明隔囊肿不会自行消失，但是一般也无需进行手术治疗，只有少数脑透明隔囊肿影响脑脊液循环造成脑积水，并且引起一些症状。这时才需要考虑通过手术方式处理脑透明隔囊肿，通常是采取神经内镜手术的方式，将脑透明隔囊肿开创，进行囊壁的部分切除，打通脑界循环，能够有效的缓解由于脑透明隔囊肿造成的脑脊液梗阻症状，使临床状况恢复到正常。

由此可见，大部分的脑透明隔囊肿不会自行消失，但同时也不会引起症状，只有很少数的脑透明隔囊肿有可能引起症状，但是也可以通过神经内镜的微创手术方式进行很好的处理。